Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clk2O35491 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clk2O35491 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clk2O35491 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clk2O35491 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clk2O35491 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clk2O35491 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clk2O35491 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clk2O35491 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clk2O35491 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clk2O35491 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clk2O35491 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Clk2O35491 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk2O35491 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clk2O35491 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clk2O35491 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms