Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc27a2O35488 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc27a2O35488 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc27a2O35488 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms