Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edil3O35474 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Edil3O35474 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Edil3O35474 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edil3O35474 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Edil3O35474 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Edil3O35474 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Edil3O35474 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Edil3O35474 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Edil3O35474 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edil3O35474 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms