Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Dgcr6O35347 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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Dgcr6O35347 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
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Dgcr6O35347 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Dgcr6O35347 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Dgcr6O35347 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Dgcr6O35347 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Dgcr6O35347 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Dgcr6O35347 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Dgcr6O35347 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Dgcr6O35347 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Dgcr6O35347 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms