Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnfrsf11aO35305 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnfrsf11aO35305 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tnfrsf11aO35305 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tnfrsf11aO35305 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms