Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
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Slc18a3O35304 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Slc18a3O35304 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Slc18a3O35304 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Slc18a3O35304 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Slc18a3O35304 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Slc18a3O35304 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc18a3O35304 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Slc18a3O35304 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Slc18a3O35304 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Slc18a3O35304 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Slc18a3O35304 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Slc18a3O35304 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Slc18a3O35304 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Slc18a3O35304 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Slc18a3O35304 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Slc18a3O35304 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc18a3O35304 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Slc18a3O35304 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms