Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfsf11O35235 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfsf11O35235 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfsf11O35235 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms