Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Bhlhe40O35185 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Bhlhe40O35185 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Bhlhe40O35185 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms