Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pitx3O35160 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pitx3O35160 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms