Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Polr1aO35134 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Polr1aO35134 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.14■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Polr1aO35134 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms