Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sema4dO09126 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sema4dO09126 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema4dO09126 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms