Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EllO08856 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EllO08856 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EllO08856 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EllO08856 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EllO08856 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EllO08856 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EllO08856 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EllO08856 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EllO08856 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EllO08856 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EllO08856 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EllO08856 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EllO08856 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EllO08856 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EllO08856 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EllO08856 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EllO08856 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EllO08856 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EllO08856 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EllO08856 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EllO08856 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EllO08856 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EllO08856 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EllO08856 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EllO08856 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EllO08856 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EllO08856 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EllO08856 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EllO08856 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EllO08856 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EllO08856 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EllO08856 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EllO08856 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EllO08856 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EllO08856 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EllO08856 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EllO08856 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EllO08856 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EllO08856 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EllO08856 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EllO08856 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EllO08856 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EllO08856 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EllO08856 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EllO08856 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EllO08856 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EllO08856 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EllO08856 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EllO08856 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms