Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

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Length 602 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EllO08856 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EllO08856 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EllO08856 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EllO08856 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EllO08856 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EllO08856 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EllO08856 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EllO08856 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EllO08856 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EllO08856 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EllO08856 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EllO08856 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EllO08856 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EllO08856 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EllO08856 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EllO08856 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EllO08856 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EllO08856 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EllO08856 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EllO08856 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EllO08856 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EllO08856 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EllO08856 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EllO08856 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
EllO08856 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EllO08856 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EllO08856 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EllO08856 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
EllO08856 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EllO08856 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
EllO08856 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EllO08856 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EllO08856 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EllO08856 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EllO08856 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EllO08856 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EllO08856 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EllO08856 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EllO08856 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EllO08856 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EllO08856 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EllO08856 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EllO08856 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EllO08856 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EllO08856 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EllO08856 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EllO08856 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EllO08856 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EllO08856 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EllO08856 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EllO08856 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EllO08856 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EllO08856 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EllO08856 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EllO08856 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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