Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ube3aO08759 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ube3aO08759 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ube3aO08759 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms