Protein–RNA interactions for Protein: O08750

Nfil3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfil3O08750 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nfil3O08750 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nfil3O08750 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nfil3O08750 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 260.6 ms