Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efna3O08545 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efna3O08545 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Efna3O08545 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Efna3O08545 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Efna3O08545 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efna3O08545 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efna3O08545 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Efna3O08545 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efna3O08545 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms