Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3488M0QW81 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gm3488M0QW81 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3488M0QW81 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms