Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm8050L7N2E3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm8050L7N2E3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm8050L7N2E3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms