Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm379J3QQ19 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gm379J3QQ19 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm379J3QQ19 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms