Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Gm21887J3QQ04 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 C730036E19Rik-201ENSMUST00000188305 1102 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Gm21887J3QQ04 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms