Protein–RNA interactions for Protein: J3QN52

Gm16427, Predicted gene 16427, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16427J3QN52 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm16427J3QN52 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm16427J3QN52 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm16427J3QN52 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms