Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
AK157302I3ITR1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
AK157302I3ITR1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
AK157302I3ITR1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms