Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf4bG5E8Z2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf4bG5E8Z2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Taf4bG5E8Z2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf4bG5E8Z2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms