Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r12G5E8G1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r12G5E8G1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r12G5E8G1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r12G5E8G1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r12G5E8G1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r12G5E8G1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r12G5E8G1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r12G5E8G1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r12G5E8G1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r12G5E8G1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Vmn1r12G5E8G1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vmn1r12G5E8G1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r12G5E8G1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms