Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b1G5E829 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp2b1G5E829 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2b1G5E829 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms