Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
4933406M09RikG3XA12 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4933406M09RikG3XA12 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4933406M09RikG3XA12 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
4933406M09RikG3XA12 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms