Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Zc3h12bG3X9I7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Zc3h12bG3X9I7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zc3h12bG3X9I7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.4 ms