Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim55G3X8Y1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trim55G3X8Y1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trim55G3X8Y1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trim55G3X8Y1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms