Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trim15G3UY57 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Trim15G3UY57 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trim15G3UY57 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.7 ms