Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Farp1F8VPU2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Farp1F8VPU2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Farp1F8VPU2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Farp1F8VPU2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms