Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm17093F6XGJ4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm17093F6XGJ4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gm17093F6XGJ4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms