Protein–RNA interactions for Protein: F6WIE4

Gm10563, Predicted gene 10563, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10563F6WIE4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Gm10563F6WIE4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gm10563F6WIE4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Gm10563F6WIE4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gm10563F6WIE4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm10563F6WIE4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm10563F6WIE4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gm10563F6WIE4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm10563F6WIE4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm10563F6WIE4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm10563F6WIE4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm10563F6WIE4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm10563F6WIE4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm10563F6WIE4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gm10563F6WIE4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms