Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Taf4E9QAP7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Taf4E9QAP7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Taf4E9QAP7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms