Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc7bE9Q9Y3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms