Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Y4

A430078G23Rik, RIKEN cDNA A430078G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430078G23RikE9Q7Y4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
A430078G23RikE9Q7Y4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
A430078G23RikE9Q7Y4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
A430078G23RikE9Q7Y4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.8 ms