Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp31E9Q6Y8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp31E9Q6Y8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Usp31E9Q6Y8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.3 ms