Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Itga10E9Q6R1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Itga10E9Q6R1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Itga10E9Q6R1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms