Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D8

C6, Complement component 6, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6E9Q6D8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6E9Q6D8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6E9Q6D8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C6E9Q6D8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C6E9Q6D8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
C6E9Q6D8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C6E9Q6D8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms