Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc85cE9Q6B2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc85cE9Q6B2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms