Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
ApobE9Q414 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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