Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
4930579F01RikE9Q3L6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
4930579F01RikE9Q3L6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
4930579F01RikE9Q3L6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms