Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Susd1E9Q3H4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Susd1E9Q3H4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Susd1E9Q3H4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms