Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Wdr17E9Q271 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Wdr17E9Q271 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Wdr17E9Q271 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms