Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
NebE9Q1W3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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