Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3893E9Q1I1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3893E9Q1I1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3893E9Q1I1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm3893E9Q1I1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm3893E9Q1I1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3893E9Q1I1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3893E9Q1I1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3893E9Q1I1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3893E9Q1I1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3893E9Q1I1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
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