Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm9972E9Q053 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gm9972E9Q053 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm9972E9Q053 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms