Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rsf1E9PWW9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
Rsf1E9PWW9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rsf1E9PWW9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rsf1E9PWW9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms