Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gimd1E9PW74 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gimd1E9PW74 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gimd1E9PW74 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms