Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm2956E9PVJ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm2956E9PVJ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm2956E9PVJ0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms