Protein–RNA interactions for Protein: E9PUU5

Zfp839, Zinc finger protein 839, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp839E9PUU5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp839E9PUU5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zfp839E9PUU5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp839E9PUU5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp839E9PUU5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zfp839E9PUU5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zfp839E9PUU5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zfp839E9PUU5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms