Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atp6ap1lD3Z5W0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atp6ap1lD3Z5W0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms